Приольхонье, как часть Ольхонского региона, является уникальным геологическим полигоном, где на современном эрозионном срезе наблюдаются выходы структур фундамента Сибирского кратона и Центрально-Азиатского складчатого пояса. Представления о структуре этого региона основываются преимущественно на результатах наземного геологического картирования и дистанционных съемок. Однако при изучении структуры Приольхонья возможности таких съемок, особенно при экстраполяции их результатов на глубину, ограничены. В связи с этим актуально привлечение геофизических методов, позволяющих осуществлять объемное геологическое картирование. В статье приводятся и обсуждаются результаты изучения регионального геологического строения Приольхонья с помощью зондирований становлением электромагнитного поля и методом естественного электрического поля. Благодаря этим исследованиям впервые выделены элементы региональной структуры Приольхонья, которые не проявляются в результатах наземных геологических съемок. Важным результатом исследований являются возникающие при геологической интерпретации геофизических данных вопросы, на которые пока нет однозначных ответов в рамках современной концепции геологического строения Приольхонья.